Peningkatan Sensitivitas Deteksi Cemaran Salmonella spp., S. Typhimurium, dan S. Enteritidis Menggunakan Multiplex PCR dengan Tahap Pre-enrichment.

Abstract

Metode deteksi cepat Salmonella spp., serta serotipe S. Typhimurium dan S. Enteritidis yang umum mencemari karkas ayam telah dikembangkan sehingga aplikasi metode tersebut dapat dilakukan untuk mendeteksi cemaran pada karkas ayam secara spesifik. Penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahap yaitu konfirmasi jumlah kultur, kontaminasi artifisial (spike), evaluasi waktu minimal teknik pre-enrichment, dan aplikasi deteksi cemaran Salmonella dengan metode multiplex PCR standar pada karkas ayam. Hasil penelitian menunjukkan penggunaan konsentrasi primer untuk target gen invA sebesar 0.400 μM, STM4497 sebesar 0.120 μM dan Prot6E sebesar 0.400 μM pada suhu annealing sebesar 58oC optimum dalam membedakan kultur murni serovar Typhimurium dan Enteritidis dengan jelas. Waktu pre-enrichment menggunakan media BPW selama 8 jam dapat membantu deteksi multiplex PCR pada jumlah awal total campuran kultur murni kontaminasi artifisial yang sangat rendah hingga 0.73 CFU/mL. Teknik preenrichment 8 jam dapat meningkatkan sensitivitas uji dengan metode multiplex PCR pada karkas ayam yang diduga memiliki jumlah awal cemaran rendah.