Peningkatan Sensitivitas Deteksi Cemaran Salmonella spp., S. Typhimurium, dan S. Enteritidis Menggunakan Multiplex PCR dengan Tahap Pre-enrichment.
View/ Open
Date
2019Author
Asthiti, Ni Gusti Ayu Made Widyatari
Nurjanah, Siti
Rahayu, Winiati P
Metadata
Show full item recordAbstract
Metode deteksi cepat Salmonella spp., serta serotipe S. Typhimurium dan
S. Enteritidis yang umum mencemari karkas ayam telah dikembangkan sehingga
aplikasi metode tersebut dapat dilakukan untuk mendeteksi cemaran pada karkas
ayam secara spesifik. Penelitian ini dilakukan dalam beberapa tahap yaitu
konfirmasi jumlah kultur, kontaminasi artifisial (spike), evaluasi waktu minimal
teknik pre-enrichment, dan aplikasi deteksi cemaran Salmonella dengan metode
multiplex PCR standar pada karkas ayam. Hasil penelitian menunjukkan
penggunaan konsentrasi primer untuk target gen invA sebesar 0.400 μM, STM4497
sebesar 0.120 μM dan Prot6E sebesar 0.400 μM pada suhu annealing sebesar 58oC
optimum dalam membedakan kultur murni serovar Typhimurium dan Enteritidis
dengan jelas. Waktu pre-enrichment menggunakan media BPW selama 8 jam dapat
membantu deteksi multiplex PCR pada jumlah awal total campuran kultur murni
kontaminasi artifisial yang sangat rendah hingga 0.73 CFU/mL. Teknik preenrichment
8 jam dapat meningkatkan sensitivitas uji dengan metode multiplex
PCR pada karkas ayam yang diduga memiliki jumlah awal cemaran rendah.