Polimorfisme Gen Calpastatin (CAST|Cfr131) Dengan Metode PCR-RFLP
Abstract
Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen
calpastatin (CAST|Cfr131) menggunakan metode PCR-RFLP. Penelitian ini
menggunakan 95 sapi bali yang terdiri dari 49 jantan dan 46 betina berasal dari
BPTU-HPT Provinsi Bali. Polimorfisme gen calpastatin dianalisis menggunakan
metode PCR-RFLP. Enzim yang digunakan untuk pemotongan adalah Cfr131
primer forward 5 'TGGGGCCCAATGACGCCATCGATG3' dan primer reverse 5
'GGTGGAGCAGCACTTCTGATCACC3'. Keragaman genetik dari gen
calpastatin dianalisis menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, derajat
heterozigositas. Keseimbangan Hardy-Weinberg diuji dengan uji Chi Kuadrat
menggunakan aplikasi PopGen 32. Hasil penelitian menunjukkan bahwa
Amplifikasi gen calpastatin terletak di intron 15 dengan suhu annealing 60 ⁰ C
selama 10 detik dengan panjang produk 624 pb. Keragaman gen calpastatin pada
bangsa sapi bali bersifat polimorfik dengan frekuensi alel G sebesar (0.86) lebih
tinggi dibanding frekuensi alel A (0.14).