Polimorfisme Gen Calpastatin (CAST|Cfr131) Dengan Metode PCR-RFLP

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi polimorfisme gen calpastatin (CAST|Cfr131) menggunakan metode PCR-RFLP. Penelitian ini menggunakan 95 sapi bali yang terdiri dari 49 jantan dan 46 betina berasal dari BPTU-HPT Provinsi Bali. Polimorfisme gen calpastatin dianalisis menggunakan metode PCR-RFLP. Enzim yang digunakan untuk pemotongan adalah Cfr131 primer forward 5 'TGGGGCCCAATGACGCCATCGATG3' dan primer reverse 5 'GGTGGAGCAGCACTTCTGATCACC3'. Keragaman genetik dari gen calpastatin dianalisis menggunakan frekuensi alel, frekuensi genotipe, derajat heterozigositas. Keseimbangan Hardy-Weinberg diuji dengan uji Chi Kuadrat menggunakan aplikasi PopGen 32. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Amplifikasi gen calpastatin terletak di intron 15 dengan suhu annealing 60 ⁰ C selama 10 detik dengan panjang produk 624 pb. Keragaman gen calpastatin pada bangsa sapi bali bersifat polimorfik dengan frekuensi alel G sebesar (0.86) lebih tinggi dibanding frekuensi alel A (0.14).