Identifikasi Keragaman Gen Solute Carrier Family 23 Member 3 (SLC23A3-NdeI) pada Ayam Silangan Kampung dan Broiler

Abstract

Salah satu gen utama pengontrol sifat perlemakan adalah Solute Carrier 23 Member 3 (SLC23A3). SLC23A3 merupakan transporter yang fungsinya belum diketahui, namun keragaman gen SLC23A3 diduga terkait dengan asam lemak dan kualitas karkas ayam. Penelitian ini dilakukan untuk mengidentifikasi keragaman gen SLC23A3 pada generasi kedua persilangan Kampung-Broiler (KBKB) dengan menggunakan metode Polymerase Chain Reaction-Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP). Sampel DNA yang digunakan untuk identifikasi keragaman sebanyak 92 sampel DNA yang terdiri dari 62 sampel DNA ayam KBKB, 15 sampel DNA ayam broiler dan 15 sampel DNA ayam kampung. Perhitungan genotip, frekuensi alel, nilai heterozigositas, dan keseimbangan Hardy-Weinberg pada penelitian ini dilakukan pada ayam persilangan kampung dan broiler. Gen diamplifikasi pada posisi c.22385690A>C dengan panjang sekuen 364 bp dan dipotong menggunakan enzim restriksi NdeI menghasilkan ; 222 and 142 bp pada genotip AA; 364, 222, dan 142 bp pada genotip AC, dan 364 pada genotip CC. Frekuensi alel tertinggi ditemukan pada alel C. Hasil identifikasi gen SLC23A3|NdeI menunjukkan populasi ayam KBKB, ayam broiler dan ayam kampung yang digunakan bersifat polimorfik (beragam) dan berada pada keseimbangan Hardy-Weinberg. SLC23A3 merupakan gen kandidat yang potensial mengontrol distribusi asam lemak ayam.