Karakterisasi gen Dopamine Receptor D4 (DRD4) pada ayam pesuara (crowing chicken) Indonesia.

Abstract

Gen dopamine receptor D4 (DRD4) merupakan gen yang berperan penting dalam menentukan sifat rasa takut (fearness) pada ayam. Fearness merupakan salah satu yang berperan dalam menentukan kualitas suara karena apabila ayam tersebut memiliki rasa takut yang tinggi maka ayam tersebut tidak berani mengeluarkan suaranya. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan karakterisasi gen DRD4 (promotor) dan menentukan situs mutasi pada ayam pesuara (ayam pelung dan bekisar) dan non pesuara (ayam kampung, sentul, dan broiler). Ayam dikelompokan menjadi 3 kelompok yaitu (1). tingkat ketakutan tinggi (ayam bekisar, n=3), (2). tingkat ketakutan rendah (ayam pelung, n=10) dan (3). Unclassified (ayam kampung n=3, sentul n=3, dan broiler n=3). Sebanyak 22 sampel individu ayam berhasil teramplifikasi dan menghasilkan fragmen gen DRD4 sepanjang 708 bp. Hasil sekuensing gen DRD4 ayam (sekuen forward) dianalisis menggunakan program MEGA 6. Gen DRD4 ayam pesuara dan non pesuara Indonesia mempunyai nilai kesamaan 97% dengan referensi sekuen gen DRD4 ayam FJ217173.1. Mutasi pada fragmen gen DRD4 ditemukan sebanyak 11 situs dengan tipe mutasi transisi, transversi, dan delesi. Mutasi basa nukleotida gen DRD4 pada kelompok ayam yang memiliki tingkat fearness tinggi (ayam bekisar) lebih tinggi (8) jika dibandingkan dengan ayam lainnya.