dc.contributor.advisor | Jakaria | |
dc.contributor.advisor | Sumantri, Cece | |
dc.contributor.author | Paramitasari, Komang Alit | |
dc.date.accessioned | 2013-07-10T06:55:14Z | |
dc.date.available | 2013-07-10T06:55:14Z | |
dc.date.issued | 2013 | |
dc.identifier.uri | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/64539 | |
dc.description.abstract | Bali cattle as one of Indonesian animal genetic resources has advantages, one of which is its high reproductive ability. Osteopontin gene (OPN) is a member of POU class 1 homeobox 1 (POU1F1) related to reproductive traits. The aim of this research was to identify the existence of OPN gene polymorphisms in bali cattle at Bali Island using the PCR-RFLP method. A total of 100 bali cattle from BPTU bali cattle were identified using BsrI restriction enzyme that cuts the sequence of ACTGG|N bases. OPN gene amplification was performed with annealing temperature of 60 oC for 20 seconds resulting in a fragment with the length of 290 bp which is located at intron 4. The results of PCR-RFLP analysis indicated that the analyzed bali cattles which have monomorphic T allele was 100%. OPN gene fragment intron 4 sequences showed that there was a mutation between cytosine (C) base with thymine (T). | en |
dc.description.abstract | Bangsa sapi bali sebagai sumberdaya genetik ternak asli Indonesia memiliki keunggulan, salah satunya adalah daya reproduksi yang tinggi. Gen osteopontin (OPN) merupakan anggota dari alur POU class 1 homeobox 1 (POU1F1) yang berkaitan dengan sifat reproduksi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi ada tidaknya polimorfisme gen osteopontin (OPN) sebagai pengontrol sifat reproduksi pada sapi bali di Pulau Bali dengan menggunakan metode PCR-RFLP. Sampel sapi bali sebanyak 100 sampel yang berasal dari BPTU sapi bali dideteksi keberadaan keragaman genetiknya pada gen OPN menggunakan enzim restriksi BsrI yang memotong sekuens basa ACTGG|N. Amplifikasi gen OPN menghasilkan fragmen dengan panjang 290 bp yang terletak pada intron 4 dengan suhu annealing 60 oC selama 20 detik. Hasil analisis PCR-RFLP menunjukkan sapi bali yang dianalisis memiliki alel monomorfik T adalah 100%. Hasil sekuens fragmen gen OPN intron 4 menunjukkan terdapat mutasi antara basa sitosin (C) dengan timin (T). | |
dc.subject | Bogor Agricultural University (IPB) | en |
dc.subject | PCR-RFLP | en |
dc.subject | osteopontin gene (OPN) | en |
dc.subject | bali cattle | en |
dc.title | Alel Monomorfik Gen Osteopontin (OPN|BsrI) pada Sapi Bali dengan Metode PCR-RFLP | en |