Autentikasi produk tuna (Thunnus sp.) kaleng dengan metode polymerase chain reaction

Abstract

Autentikasi bahan pangan merupakan salah satu tantangan bagi para pelaku bisnis pangan, termasuk pangan perikanan. Autentikasi konvensional berbasis morfologi memiliki kekurangan utama berupa ketergantungan akan kehadiran ahli dan kelengkapan morfologi dari ikan itu sendiri. Kelengkapan morfologi ikan dari pangan olahan tidak lagi utuh karena telah mengalami proses sterilisasi komersial, misalnya pada produk tuna dalam kaleng. Analisis berbasis protein juga memiliki kekurangan karena proses denaturasi protein selama pemasakan dan sterilisasi yang menyebabkan perubahan pada profil protein yang hendak diamati. Salah satu cara untuk dapat mengindentifikasi spesies yang telah mengalami perubahan bentuk dan denaturasi protein yang diakibatkan oleh proses fisika dan kimia adalah PCR-sequencing. Polymerase chain reaction dilakukan untuk mengamplifikasi gen cyt-b DNA mitokondria. Gen cyt-b dari DNA mitokondria digunakan dalam penelitian ini karena beberapa kelebihan yang dimiliki, yaitu bentuknya yang sirkular relatif lebih resisten terhadap suhu tinggi, kelimpahannya dalam sel tinggi, mengikuti garis keturunan ibu, tidak mengalami rekombinasi, tingkat mutasi sangat tinggi sehingga dapat digunakan untuk studi filogenetik. DNA empat spesies tuna segar dan tuna kaleng dapat diekstraksi menggunakan metode CTAB. DNA hasil ekstraksi kemudian diamplifikasi dengan menggunakan primer fishcytb-f dan cytb1-5r.