Identifikasi Keragaman Genetik Gen Uterine Milk Protein pada Sapi Bali

Abstract

Gen UTMP merupakan salah satu gen yang berperan penting dalam fungsi reproduksi pada ternak, termasuk sapi. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi keragaman gen UTMP pada sapi bali. Penelitian dilakukan di Divisi Pemuliaan dan Geneteika Ternak FAPET IPB. Penelitian ini melibatkan 40 sampel sapi bali terdiri atas 20 sampel sapi bali betina dari BPTU-HPT Denpasar, 10 sampel sapi bali jantan dari BIB Singosari dan 10 sampel sapi bali jantan dari BIB Baturiti. Identifikasi keragaman gen UTMP menggunakan metode PCR-sequencing. Data dianalisis deskriptif untuk menentukan frekuensi tipe pitanya. Hasil amplifikasi gen UTMP pada sapi bali diperoleh tiga tipe pita yaitu tipe A (405 pb), tipe B (444 pb dan 405 pb), dan C (444 pb dan 288 pb). Pada populasi sapi bali betina ditemukan tipe pita B dan pada populasi sapi bali jantan ditemukan tipe pita C. Frekuensi tipe pita tertinggi terjadi pada tipe pita A (0,95) dibanding tipe pita B (0,025) dan tipe C (0,025). Analisis sekuens menunjukkan terdapat mutasi duplikat dan delesi pada tipe pita yang berada di luar target (405 pb). Mutasi duplikat menyebabkan panjang fragmen bertambah menjadi 444 pb. Mutasi delesi menyebabkan panjang fragmen berkurang menjadi 288 pb. Keragaman genetik gen UTMP sapi bali berdasarkan tipe pita tergolong rendah.