Pemanfaatan Gen Pengkode odc dan ldc untuk Deteksi Dini Pembentukan Putresin dan Kadaverin pada Ikan Scombridae
View/ Open
Date
2020Author
Nadya, Hani Fildzah
Abdullah, Asadatun
Nurilmala, Mala
Metadata
Show full item recordAbstract
Putresin dan kadaverin merupakan jenis biogenik amin yang terbentuk
melalui proses dekarboksilasi asam amino, yaitu ornitin dan lisina dengan enzim
yang terlibat adalah ornitin dekarboksilase dan lisin dekarboksilase. Gen pengkode
enzim tersebut dapat dimanfaatkan dalam metode pendeteksi dini secara molekuler,
yaitu pada mikroorganisme pembentuk putresin dan kadaverin. Pada penelitian ini,
pendeteksian tersebut dilakukan melalui tahap pre-enrichment dan non preenrichment
mikroba yang terdapat pada sampel, isolasi DNA bakteri menggunakan
TianGen DNA kit dan CTAB 2%, amplifikasi DNA menggunakan primer spesifik
PUT1 dan CAD1 serta primer universal 16S rRNA. DNA bakteri yang terdapat
pada ikan scombroid dengan metode pre-enrichment berhasil diisolasi. Gen ldc
berhasil diamplifikasi dengan primer CAD1 pada ukuran 1 098 bp. Isolat bakteri
secara umum juga berhasil diamplifikasi dengan primer 16S rRNA pada ukuran
1 500 bp. Jenis bakteri pengkode gen ldc yang terdeteksi berasal dari famili
Enterobacteriaceae dimana spesies Enterobacter chengduensis memiliki
kesamaan dengan bakteri pada ikan tuna, dan Enterobacter roggenkampii memiliki
kesamaan dengan bakteri pada ikan tongkol dan cakalang.