| dc.description.abstract | InDel merupakan salah satu marka molekuler yang memiliki potensi dalam
menganalisis keragaman genetik. Tujuan dalam penelitian ini adalah menguji
kemampuan 19 primer InDel dalam menganalisis keragaman genetik 24 genotipe
kakao lokal. Hasil skoring pita-pita hasil ampifikasi DNA kakao menunjukkan dari
19 primer IDCc, 18 primer bersifat polimorfis dan 1 primer monomorfis (IDCc 7.2).
Nilai rata-rata polymorphism information content (PIC) dari 19 primer IDCc yang
digunakan cukup rendah (0.369), frekuensi alel utama sebesar 0.665, jumlah alel
terdeteksi sebesar 2.563, diversitas gen sebesar 0.435, dan heterozigositas sebesar
0.050. Primer IDCc dengan nilai PIC terbaik terdapat pada primer IDCc 8.2 (0.624),
IDCc 9.1 (0.531), dan IDCc 10.1 (0.549). Analasis filogenetik 24 genotipe kakao
lokal menghasilkan tiga kelompok pada koefisien kemiripan sebesar 0.56,
kelompok pertama terdapat 7 genotipe, kelompok kedua 16 genotipe, dan kelompok
ketiga terdapat 1 genotipe. Jarak terjauh dimiliki oleh genotipe TSH 858 dan DRC
16. Semakin jauh jarak genetik setiap genetik, maka potensi untuk dijadikan sebagai
tetua dalam pemuliaan tanaman semakin besar | id |
