Isolasi dan Identifikasi Gen Penyandi Hormon Insulin-like Growth Factor-1 (IGF-1) Secara Parsial pada Ikan Cupang Betta imbellis.

Abstract

Betta imbellis merupakan salah satu spesies ikan cupang alam yang tengah dikembangkan di Balai Riset Budidaya Ikan Hias Depok. Hormon insulin-like growth factor-1 (IGF-1) merupakan salah satu hormon yang berperan dalam pertumbuhan ikan. Hormon IGF-1 berfungsi sebagai mediator kerja dari hormon pertumbuhan (GH) dalam mengatur pertumbuhan. Tujuan dari penelitian ini adalah untuk mengisolasi dan mengidentifikasi gen penyandi hormon IGF-1 secara parsial pada ikan cupang B. imbellis. cDNA disintesis dari RNA total yang diisolasi dari organ hati. Amplifikasi gen dilakukan dengan menggunakan metode polymerase chain reaction (PCR) dengan primer F-IGF-1 dan R-IGF-1 yang didesain dengan menyejajarkan sekuen gen IGF-1 dari Ictalurus punctatus, Clarias batrachus, Oreochromis niloticus, Tachysurus fulvidraco, dan Danio rerio. Hasil amplifikasi PCR menunjukkan adanya pita DNA yang berukuran 280 bp dan 361 bp. Analisis nukleotida menunjukkan bahwa kedua cDNA masing-masing menyandikan 92 dan 119 residu asam amino, dan merupakan varian IGF-1 berdasarkan sekuen domain E. Sekuen cDNA tersebut memiliki bagian yang merupakan domain khas IGF-1 dan domain khas ini memiliki tingkat homologi yang tinggi terhadap gen IGF-1 ikan gurami. Analisis pohon filogenetik menunjukkan bahwa gen IGF-1 B. imbellis berada dalam grup IGF-1 ikan yang ada di pangkalan data Genbank.