Analisis keragaman genetik rizobakteri penghasil asam indol asetat asal Sukabumi menggunakan ARDRA Gen 16S rRNA
View/ Open
Date
2015Author
Nurarfa, Whyranti
Setyawati, Inda
Suryadi, Yadi
Metadata
Show full item recordAbstract
Rizobakteri merupakan mikroorganisme menguntungkan yang hidup
berkoloni di lapisan tanah tipis sekitar zona perakaran yang memiliki kemampuan
meningkatkan pertumbuhan tanaman dengan menghasilkan hormon asam indol
asetat (AIA). Kestabilan dan keanekaragaman rizobakteri dapat terancam seiring
penggunaan pupuk sintetis dan pestisida dalam frekuensi yang tinggi. Tujuan
penelitian ini adalah mengidentifikasi keragaman genetik rizobakteri penghasil
asam indol asetat yang diisolasi dari lahan pertanian Sukabumi menggunakan
ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis). Hormon AIA tertinggi
dimiliki oleh isolat asal tanah tanaman singkong daerah Makasari dengan konsentrasi
376.86 ppm. Hasil analisis ARDRA diharapkan dapat bermanfaat sebagai
penambah kultur koleksi rizobakteri. Keragaman genetik rizobakteri dianalisis
menggunakan ARDRA dengan enzim restriksi Rsal. Enzim ini membentuk 5 pola
pita pada 8 isolat bakteri terpilih. Keragaman genetik yang dihasilkan dapat
dinyatakan kurang beragam dilihat dari sedikitnya kelompok dan Filotipe yang
terbentuk pada pohon filogenetik, namun memiliki kekerabatan yang cukup dekat.
Berdasarkan hasil sekuensing gen 16S rRNA diketahui kedua isolat sampel
rizobakteri yaitu SC 2 dan SM 1 termasuk dalam spesies yang sama, yaitu
Bacillus amyloliquefaciens FZB42 and B. amyloliquefaciens MPA 1034.
Collections
- UT - Biochemistry [1235]