Studi keragaman genetika populasi udang galah, Macrobrachiumm rosenbergii berdasarkan Polimorfisme Mitokondria DNA

Abstract

Indonesia dikenal sebagai pusat keberadaan spesies asli udang galah karena masih terdapat 19 spesies asli Indonesia. Udang galah Macrobrachium rosenbergii merupakan salah satu jenis udang Palaemonid air tawar yang umum dibudidayakan di Indonesia. Di alam bebas udang galah sering ditangkap di sekitar sungai, danau, dan rawa - rawa. Di Indonesia udang galah banyak terdapat di wilayah Pulau Sumatra, Pulau Kalimantan, sedangkan di Pulau Jawa, Sulawesi, dan Papua hanya sedikit ditemukan. Keragaman populasi genetik sangat penting untuk menjaga populasi, yang akan memberikan respon paralel terhadap perubahan parameter-parameter lingkungan. Pengamatan variasi atau keragaman genetik dapat dilakukan dengan dua cara yaitu melalui keragaman ale! (allelic diversity) dan heterozigositas. Estimasi keragaman genetik dapat dilakukan dengan menggunakan penanda­penanda molekuler. Salah satu penanda molekuler yang umum digunakan dalam bidang manajemen dan budidaya perikanan adalah penanda DNA mitokondria (mtDNA). Sekuens mtDNA CO-I udang galah yang diperoleh dari hasil amplifikasi memiliki panjang susunan basa antara 700-1500 bp. Dari tujuh enzim restriksi yang digunakan untuk memotong sekuens tersebut (Hae III, Rsa I, Mbo I, Taq I, Alu I, Sac I, dan Hin6 I), hanya terdapat empat enzim yang memberikan situs pemotongan pada sekuens mtDNA CO-I. Lokasi pengambilan koleksi udang galah akan mempengaruhi tingkat variasi haplotype dari tipe restriksi sekuens mtDNA CO-I udang galah.