Pendekatan Similarity Search dan Penambatan Molekul Senyawa Butyrolactone III terhadap Enzim α-Glukosidase sebagai Inhibitor
Date
2023-09-25Author
Musthofa, Muhammad
Ambarsari, Laksmi
Purwanto, Ukhradiya Magharaniq Safira
Metadata
Show full item recordAbstract
Obat-obat komersil yang tersedia dengan mekanisme penghambatan
enzim α-glukosidase memiliki efek samping. Oleh karena itu, proses penelitian
masih melakukan pencarian dan pengembangan senyawa baru dengan potensi
inhibisi kuat dan efek samping lebih kecil. Kandidat inhibitor, butyrolactone III,
mampu menghambat aktivitas enzim α-glukosidase secara in vitro. Penelitian ini
bertujuan mencari kandidat baru inhibitor α-glukosidase menggunakan pendekatan
similarity search terhadap butyrolactone III. Langkah penelitian antara lain,
preparasi struktur protein, pencarian ligan-ligan uji berbasis similarity search,
validasi gridbox, penapisan virtual, identifikasi interaksi kompleks enzim-ligan,
dan prediksi toksisitasnya. Hasilnya diperoleh struktur kristal dengan PDB ID
3L4U dan 46 ligan uji. Terdapat tujuh ligan yang lolos penapisan virtual, namun
tiga diantaranya tidak lolos uji prediksi toksisitas. Ligan terbaik yang diperoleh
adalah asperjinone, ligan dari A. terreus, dengan nilai energi bebas Gibbs dan Kd
terendah. Seluruh interaksi kompleks asperjinone-enzim berada pada situs
pengikatan substrat enzim.
Collections
- UT - Biochemistry [1260]