| dc.description.abstract | Scirpophaga incertulas (penggerek batang padi kuning) merupakan hama utama padi yang
menjadikan padi sebagai inang satu-satunya serangga ini. Spesies tersebut pada saat fase larva
merusak tanaman padi dengan menggerek bagian pelepah daun dan batang. Dalam upaya
pengendalian hama utama padi tersebut, analisis berdasarkan suatu gen dapat digunakan sebagai
monitoring untuk memantau suatu populasi suatu organisme. Belum adanya data genetik S.
incertulas pada daerah gen cytochrome oxidase 2 (cox2) di Indonesia maka penelitian ini
bertujuan untuk mempelajari variasi genetik S. incertulas berdasarkan gen cox2 dengan metode
sekuens DNA. Eksplorasi S. incertulas dilakukan di daerah Bogor dan areal persawahan pantai
utara Jawa Barat: Karawang, Indramayu dan Cirebon. Variasi genetik S. incertulas berdasarkan
gen cox2 ditemukan sebanyak empat haplotipe. Haplotipe 1 merupakan haplotipe umum yang
ditemukan dibanyak sampel dari keempat daerah yang dieksplorasi (Bogor, Karawang, dan
Indramayu). Haplotipe 2, 3 dan 4 berturut-turut ditemukan pada S. incertulas populasi Bogor
(Sc11Bg), Karawang (Sc24Kr) dan Cirebon (Sc1Cb). Haplotipe 2 dicirikan dengan adanya
nukleotida A pada posisi nukleotida ke-162. Haplotipe 3 dicirikan dengan adanya nukleotida G
pada posisi ke-51 dan haplotipe 4 dicirikan dengan adanya nukleotida C pada posisi nukleotida ke-
63. Variasi yang terjadi antar individu dalam satu populasi hanya terjadi di daerah Bogor dan
Karawang.
ABSTRACT | id |
