Analisis In silico Potensi Senyawa Mirisitrin Sebagai Inhibitor IKKβ dan TLR2 dalam Meredam Badai Sitokin yang Disebabkan SARS-CoV-2
Date
2023Author
Dhani, Achmad
Syaefudin
Falah, Syamsul
Kurniasih, Rini
Metadata
Show full item recordAbstract
COVID19 menyebabkan banyak kasus kematian melalui inflamasi dari
badai sitokin. Protein E dari SARS-CoV-2 bersifat sebagai agonis TLR2 (Toll-like
receptor 2) yang menjadi pemicu kaskade sinyal inflamasi Nf-ᴋβ (nuclear factor
kappa B). Flavonoid terbukti dapat menjadi inhibitor untuk IKKβ (inhibitor of
nuclear factor kappa-B kinase subunit beta) dan TLR2. Mirisitrin merupakan
flavonoid yang terdapat di daun salam (Syzygium polyanthum). Penelitian ini
bertujuan menganalisis dan mengevaluasi senyawa mirisitrin sebagai penghambat
IKKβ dan TLR2 dalam jalur Nf-ᴋβ dengan penambatan molekuler. Berdasarkan
hasil, mirisitrin lolos pengujian Lipinski dan tidak toksik untuk dikonsumsi.
Penambatan mirisitrin dengan IKKβ mendapatkan hasil energi bebas dan
konstanta inhibisi yang kecil dengan nilai -8.6220 kkal/mol dan 0.471 μM.
Penambatan mirisitrin dengan TLR2 juga mendapatkan hasil yang bernilai kecil
yaitu -8.2020 kkal/mol dan 0.958 μM. Mirisitrin membentuk banyak ikatan
hidrogen serta berikatan pada situs aktif yang mempunyai peran penting di IKKβ
dan TLR2 sehingga berpotensi sebagai inhibitor. Numerous death cases have been reported due to COVID-19-induced
inflammation caused by cytokine storms. The E protein from SARS-CoV-2 has
been identified as an agonist of Toll-like receptor 2 (TLR2), which triggers the
nuclear factor kappa B (Nf-ᴋβ) inflammation signaling cascade. Previous research
has demonstrated that flavonoids can serve as inhibitors for IKKβ (inhibitor of
nuclear factor kappa-B kinase subunit beta) and TLR2. Myricitrin is a flavonoid
found in bay leaf (Syzygium polyanthum). The purpose of this research is to
evaluate myricitrin as an inhibitor for IKKβ and TLR2 of the Nf-ᴋβ pathway with
molecular docking. Results showed that myricitrin passed the Lipinski test and
was non-toxic. The binding of myricitrin with IKKβ yielded a small free energy
and inhibition constant with values of -8.6220 kcal/mol and 0.471 μM,
respectively. The docking of myricitrin with TLR2 also yielded low value results,
namely -8.2020 kcal/mol and 0.958 μM, respectively. Myricitrin formed
numerous hydrogen bonds and bound to active sites that play a vital role in IKKβ
and TLR2, indicating its potential as an inhibitor.
Collections
- UT - Biochemistry [1235]