View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biology
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Undergraduate Theses
      • UT - Faculty of Mathematics and Natural Sciences
      • UT - Biology
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Konfirmasi Identitas Beauveria bassiana Asal Serangga Mati Menggunakan Primer EF1-

      Thumbnail
      View/Open
      Fullteks (5.833Mb)
      Date
      2020
      Author
      Dzaky, Ahmad
      Listiyowati, Sri
      Rahayu, Gayuh
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Cendawan entomopatogen (CE) yang akan dikembangkan sebagai bioinsektisida perlu memiliki identittas yang akurat. Pleomorfisme pada CE berpotensi pada kesalahan identifikasi ketika identifikasi hanya berdasarkan ciri morfologi. Salah satu alternatif cara identifikasi yang banyak digunakan adalah identifikasi secara molekuler dengan kombinasi marka blok IGS, EF1- RPB1 dan RPB2. Namun, identifikasi berdasarkan gen tunggal, EF1- belum pernah dilaporkan. Pada penelitian ini kultur CE, KRC4.6GL1 yang sebelumnya teridentifikasi sebagai Beauveria bassiana berdasarkan sekuens ITS terbatas dikonfirmasi ulang identitasnya menggunakan sekuen EF1-. Konfirmasi dilakukan dengan pendekatan filogenetik menggunakan metode Maximum Parsimony dan Bootstrap 1000 kali pada perangkat lunak MEGA X. Hasil penelitian menunjukkan bahwa daerah EF 1-  memiliki ukuran sekitar 1000 pb. Pada pohon EF1- KRC4.6GL1 berada pada clade yang sama dengan neotipe B. bassiana dengan dukungan bootstrap sebesar 92%. Rekonstruksi ulang pohon ITS dengan melibatkan lebih banyak sekuen rujukan daripada penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa KRC4.6GL1 berada dalam satu clade dengan neotipe B. bassiana dengan nilai bootstrap yang lebih rendah (70%). Hasil ini mengindikasikan EF1- memiliki kekuatan identifikasi yang lebih tinggi daripada ITS. Selain itu, KRC4.6GL1 terkonfirmasi sebagai B. bassiana.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/106261
      Collections
      • UT - Biology [2400]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository