Konfirmasi Identitas Beauveria bassiana Asal Serangga Mati Menggunakan Primer EF1-
View/ Open
Date
2020Author
Dzaky, Ahmad
Listiyowati, Sri
Rahayu, Gayuh
Metadata
Show full item recordAbstract
Cendawan entomopatogen (CE) yang akan dikembangkan sebagai bioinsektisida perlu memiliki identittas yang akurat. Pleomorfisme pada CE berpotensi pada kesalahan identifikasi ketika identifikasi hanya berdasarkan ciri morfologi. Salah satu alternatif cara identifikasi yang banyak digunakan adalah identifikasi secara molekuler dengan kombinasi marka blok IGS, EF1- RPB1 dan RPB2. Namun, identifikasi berdasarkan gen tunggal, EF1- belum pernah dilaporkan. Pada penelitian ini kultur CE, KRC4.6GL1 yang sebelumnya teridentifikasi sebagai Beauveria bassiana berdasarkan sekuens ITS terbatas dikonfirmasi ulang identitasnya menggunakan sekuen EF1-. Konfirmasi dilakukan dengan pendekatan filogenetik menggunakan metode Maximum Parsimony dan Bootstrap 1000 kali pada perangkat lunak MEGA X. Hasil penelitian menunjukkan bahwa daerah EF 1- memiliki ukuran sekitar 1000 pb. Pada pohon EF1- KRC4.6GL1 berada pada clade yang sama dengan neotipe B. bassiana dengan dukungan bootstrap sebesar 92%. Rekonstruksi ulang pohon ITS dengan melibatkan lebih banyak sekuen rujukan daripada penelitian sebelumnya menunjukkan bahwa KRC4.6GL1 berada dalam satu clade dengan neotipe B. bassiana dengan nilai bootstrap yang lebih rendah (70%). Hasil ini mengindikasikan EF1- memiliki kekuatan identifikasi yang lebih tinggi daripada ITS. Selain itu, KRC4.6GL1 terkonfirmasi sebagai B. bassiana.
Collections
- UT - Biology [1976]