Analisis Kekerabatan Progeni Hasil Persilangan Durio zibethinus Murr. x Durio kutejensis Taman Buah Mekarsari Berdasarkan Karakter Vegetatif dan Marka Mikrosatelit.

Abstract

Durian (Durio sp.) merupakan tanaman buah asli Indonesia dari famili Malvaceae yang memiliki keragaman genetik tinggi di alam. Analisis keragaman genetik durian menjadi informasi dasar untuk pelaksanaan kegiatan seleksi dan persilangan lanjutan dalam program pemuliaan durian. Marka mikrosatelit merupakan salah satu metode analisis penanda molekuler kodominan. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi kekerabatan 5 aksesi durian Mekarsari hasil persilangan Durio zibethinus Murr. (Durian Matahari) x Durio kutejensis (Lai) dan kedua tetuanya dengan 1 outgrup Durio dulcis berdasarkan karakter vegetatif dan marka mikrosatelit. DNA diisolasi menggunakan DNeasy® Plant Pro Kit. Delapan primer mikrosatelit yang digunakan adalah MS1CT-5FD2, MS1CT-6FA1, MS1CT-12FB2, MS1GT-15FB1, MS1GT-22FA2, MS1GT-27FC1, MS1AAC-5FC2, MS1AAC- 19FD1. Analisis marka mikrosatelit menggunakan PCR Type-it Multiplex Master Mix. Analisis filogenetik menggunakan metode algoritma UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean) pada software Phylip. Rata-rata alel yang didapat dari 8 lokus yang diuji ± 7. Terdapat 2 pasang lokus yang memiliki NA paling tinggi yaitu lokus MS1AAC-19 dan MS1GT-22 yang memiliki alel masing-masing 9 serta lokus MS1GT-15 dan MS1GT-27 yang masing-masing memiliki alel 8. DPR 1, DPR 6, DPR 7, DPR 8, dan DPR 13 memiliki jarak kekerabatan yang dekat dengan durian Matahari sebagai tetua betina secara genetik dan morfologi dibanding Lai.