Analisis Kekerabatan Progeni Hasil Persilangan Durio zibethinus Murr. x Durio kutejensis Taman Buah Mekarsari Berdasarkan Karakter Vegetatif dan Marka Mikrosatelit.
View/ Open
Date
2020Author
Nugroho, Faizal Adi
Sobir
Matra, Deden Derajat
Metadata
Show full item recordAbstract
Durian (Durio sp.) merupakan tanaman buah asli Indonesia dari famili
Malvaceae yang memiliki keragaman genetik tinggi di alam. Analisis keragaman
genetik durian menjadi informasi dasar untuk pelaksanaan kegiatan seleksi dan
persilangan lanjutan dalam program pemuliaan durian. Marka mikrosatelit
merupakan salah satu metode analisis penanda molekuler kodominan. Penelitian ini
bertujuan mengidentifikasi kekerabatan 5 aksesi durian Mekarsari hasil persilangan
Durio zibethinus Murr. (Durian Matahari) x Durio kutejensis (Lai) dan kedua
tetuanya dengan 1 outgrup Durio dulcis berdasarkan karakter vegetatif dan marka
mikrosatelit. DNA diisolasi menggunakan DNeasy® Plant Pro Kit. Delapan primer
mikrosatelit yang digunakan adalah MS1CT-5FD2, MS1CT-6FA1, MS1CT-12FB2,
MS1GT-15FB1, MS1GT-22FA2, MS1GT-27FC1, MS1AAC-5FC2, MS1AAC-
19FD1. Analisis marka mikrosatelit menggunakan PCR Type-it Multiplex Master
Mix. Analisis filogenetik menggunakan metode algoritma UPGMA (Unweighted
Pair Group Method with Arithmetic Mean) pada software Phylip. Rata-rata alel
yang didapat dari 8 lokus yang diuji ± 7. Terdapat 2 pasang lokus yang memiliki
NA paling tinggi yaitu lokus MS1AAC-19 dan MS1GT-22 yang memiliki alel
masing-masing 9 serta lokus MS1GT-15 dan MS1GT-27 yang masing-masing
memiliki alel 8. DPR 1, DPR 6, DPR 7, DPR 8, dan DPR 13 memiliki jarak
kekerabatan yang dekat dengan durian Matahari sebagai tetua betina secara genetik
dan morfologi dibanding Lai.