Analisis Keragaman Genetik Graptophyllum pyctum dari 10 Etnis di Indonesia Bagian Barat Berbasis Marka Molekular SRAP

Abstract

dengan beragam nama lokal dan khasiat sesuai etnis penggunanya. Penelitian ini dilakukan untuk mengetahui polimorfisme dan filogenetik G. pyctum antar etnis dan aksesi. Isolasi genom dilakukan dengan GeneJET Plant Genomic DNA Purification Mini Kit. Amplifikasi PCR menggunakan primer SRAP. Pengolahan data menggunakan NTSYS dan PopGene 1.3. Terdapat 8 kombinasi primer terpilih dengan persen polimorfik rerata 72,23% dan total 45 lokus. Etnis dengan persen polimorfik tertinggi adalah etnis Kutai (55,56%). Keragaman antar populasi dan aksesinya tergolong sedang (ID<0,69). Etnis Ribun adalah tetua dengan lokus ke-24 dan 41 sebagai lokus penanda. Etnis dengan kekerabatan G. pyvtum terdekat adalah Tasik-Pagatan (ID=0,0094), sedangkan yang terjauh adalah Ribun-Pagatan (ID=0,4359). Sebesar 81,29% keragaman dapat dijelaskan oleh 8 PC teratas yang mencakup 17 alel utama. Terdapat 4 klaster yang memisahkan 28 aksesi secara acak dan tidak mengikuti pola etnis maupun geografisnya.