Analisis Keragaman Genetik Graptophyllum pyctum dari 10 Etnis di Indonesia Bagian Barat Berbasis Marka Molekular SRAP
View/ Open
Date
2019Author
Prastiwi, Danty Oktiana
Andrianto, Dimas
Puspita, Puspa Julistia
Metadata
Show full item recordAbstract
dengan beragam nama lokal dan khasiat sesuai etnis penggunanya. Penelitian ini
dilakukan untuk mengetahui polimorfisme dan filogenetik G. pyctum antar etnis
dan aksesi. Isolasi genom dilakukan dengan GeneJET Plant Genomic DNA
Purification Mini Kit. Amplifikasi PCR menggunakan primer SRAP. Pengolahan
data menggunakan NTSYS dan PopGene 1.3. Terdapat 8 kombinasi primer
terpilih dengan persen polimorfik rerata 72,23% dan total 45 lokus. Etnis dengan
persen polimorfik tertinggi adalah etnis Kutai (55,56%). Keragaman antar
populasi dan aksesinya tergolong sedang (ID<0,69). Etnis Ribun adalah tetua
dengan lokus ke-24 dan 41 sebagai lokus penanda. Etnis dengan kekerabatan G.
pyvtum terdekat adalah Tasik-Pagatan (ID=0,0094), sedangkan yang terjauh
adalah Ribun-Pagatan (ID=0,4359). Sebesar 81,29% keragaman dapat dijelaskan
oleh 8 PC teratas yang mencakup 17 alel utama. Terdapat 4 klaster yang
memisahkan 28 aksesi secara acak dan tidak mengikuti pola etnis maupun
geografisnya.
Collections
- UT - Biochemistry [1327]