Seleksi Khamir Penghasil Bioetanol dan Analisis Filogenetik Berdasarkan Sekuen Daerah Internal Transcribed Spacer

Abstract

Kebutuhan bahan bakar yang semakin bertambah perlu diiringi upaya untuk mencari sumber energi alternatif seperti bioetanol. Khamir umum digunakan untuk fermentasi bioetanol. Penelitian ini bertujuan melakukan seleksi khamir penghasil bioetanol dengan konsentrasi tinggi menggunakan high-performance liquid chromatography (HPLC) dan mengidentifikasi keragaman genetik atau analisis filogenetik dengan mengamplifikasi daerah internal transcribed spacer (ITS). Hasil penelitian ini menunjukkan khamir mampu hidup dalam konsentrasi glukosa dan xilosa tinggi, tetapi tidak mampu mengonsumsi selulosa. Isolat khamir yang berpotensi menghasilkan kadar etanol tinggi adalah RAGI NKL 10.5.2.3 dan TKH (BGR) 10.5.2.1 yakni sebesar 2.61 g/L. Amplifikasi pada daerah ITS berhasil dilakukan dengan ukuran amplikon 400-900 pb. Amplikon pada domain D1/D2 26s rDNA sebesar 250 pb. Amplifikasi dengan primer spesifik ScerF2 dan ScerR2 berhasil dilakukan dan membuktikkan terdapat dua isolat yang bukan golongan Saccharomyces cerevisiae. Analisis keragaman genetik khamir menunjukkan 13 isolat khamir tergolong Saccharomyces cerevisiae dan sisanya masuk ke dalam genus Clavispora, Candida, dan Kodamaea (Pichia).