| dc.description.abstract | Kuda laut (Hippocampus spp.) termasuk ke dalam Famili Syngnathidae
yang memiliki tubuh bersegmen, sirip dada, sirip punggung, sirip dubur, dan tidak
mempunyai sirip ekor. Kuda laut sulit dibedakan berdasarkan warna, bentuk, dan
ukuran tubuh saja. Fenomena cryptic dan complex species pada kuda laut
menyebabkan kesalahan identifikasi secara morfologi. Distribusi kuda laut di
Indonesia terdapat di perairan Kepulauan Riau dan Lampung. Identifikasi secara
molekuler dapat meningkatkan keakuratan dan meminimalkan kesalahan
identifikasi. Salah satu teknik dalam identifikasi molekuler yaitu DNA barcoding.
Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi kuda laut secara molekuler dan
menganalisis hubungan kekerabatan kuda laut berdasarkan gen 16S rRNA dan COI
di perairan Kepulauan Riau dan Lampung. Ekstraksi DNA menggunakan Qiamp
DNA Blood and Tissue kit Qiagen. Hasil identifikasi kuda laut secara molekuler
berdasarkan gen 16S rRNA dan COI di perairan Kepulauan Riau merupakan spesies
H. comes (N = 2) dan H. kuda (N = 1). Berdasarkan gen 16S rRNA dan COI kuda
laut di perairan Lampung merupakan spesies H. comes (N = 3). Nilai jarak genetik
H. comes di perairan Kepulauan Riau dan Lampung berdasarkan gen 16S rRNA
dan gen COI yaitu 0.000 dan 0.000 – 0.002. Nilai jarak genetik H. comes dan H.
kuda berdasarkan gen 16S rRNA dan COI yaitu 0.064 dan 0.115. Berdasarkan gen
16S rRNA pada H. comes di perairan Kepulauan Riau (N = 2) dan Lampung (N =
3) ditemukan 1 haplotipe (haplotipe 1; N = 5). Berdasarkan gen COI pada H. comes
di perairan Kepulauan Riau (N = 2) ditemukan 1 haplotipe (haplotipe 1; N = 2).
Berdasarkan gen COI pada H. comes di perairan Lampung (N = 3) ditemukan 2
haplotipe (haplotipe 1; N = 2, dan haplotipe 2; N = 1). Analisis filogenetik H. comes
di perairan Kepulauan Riau dan Lampung identik berdasarkan gen 16S rRNA dan
COI. Berdasarkan analisis filogenetik gen 16S rRNA dan COI H. kuda di perairan
Kepulauan Riau (N=1) termasuk ke dalam lineage B (Samudera Hindia). | id |
