Seleksi dan Optimasi Primer Spesifik Penyandi Gen Tripsin Inhibitor dan Aktin sebagai Marka Molekuler Ketahanan Hama pada Sengon (Falcataria moluccana).

Abstract

Sengon (F. moluccana) merupakan salah satu pohon yang dikelompokan sebagai pohon yang memiki banyak fungsi, mudah ditanam, cepat tumbuh, serta bernilai ekonomis. Sifat-sifat tersebut menjadikan sengon banyak dibudidayakan di masyarakat. Namun, adanya serangan hama penggerek batang atau boktor (Xystrocera festiva) menyebabkan kerugian besar dalam pembudidayaannya. Penelitian ini bertujuan mendapatkan marka molekuler yang berbasis gen ketahanan dalam upaya pengendalian serangan boktor, yakni gen tripsin inhibitor (TI). Perancangan primer spesifik yang dilakukan menghasilkan lima kandidat primer TI dan empat kandidat primer aktin. DNA sengon berhasil diisolasi pada penelitian ini. Hasil amplifikasi menunjukkan hanya primer AcTI, TaACT, dan AcACT yang menghasilkan amplikon sesuai ukuran target. Analisis homologi pada ketiga amplikon tersebut memiliki tingkat kesamaan yang cukup tinggi terhadap gen penyandi TI dan aktin lainnya di database. Selain itu, ketiga sekuen amplikon tersebut juga menunjukkan adanya prediksi daerah conserved domain. Gen TI nantinya akan dideteksi ekspresinya dengan Real-Time PCR, menggunakan gen aktin sebagai kontrol.