Analisis Keragaman Genetik Kedelai Transgenik Turunan Keempat (T4) dan Varietas Unggul Nasional Berbasis Marka SSR

Abstract

Tanaman kedelai transgenik dapat menambah koleksi plasma nutfah tanaman kedelai dan meningkatkan keberagaman kedelai. Keberagaman pada kedelai membutuhkan karakterisasi secara molekuler untuk mengetahui jarak kekerabatan antar varietas kedelai. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasijarak kekerabatan genetik kedelai transgenik turunan keempat (T4) dan beberapa kedelai varietas unggul nasional menggunakan marka SSR. Tahapan analisis keragaman genetik tersebut diawali dengan isolasi sampel DNA kedelai menggunakan metode Doyle dan Doyle termodifikasi, amplifikasi DNA menggunakan PCR dan selanjutnya analisis polimorfisme dan filogeni.Lima belas sampel DNA kedelai yang diukur memiliki konsentrasi DNA yang berkisar dari 6.4 – 516.4 ng/μl. Hasil amplifikasi sampel DNA kedelai menunjukkan ukuran produk hasil amplifikasi berkisar pada 100-200 pasang basa (bp). Rerata nilai PIC (Polymorphic Information Content) yang diperoleh sebesar 0,36. Hasil dendogram mengelompokkan 15 sampel tanaman kedelai menjadi 2 kelompok utama pada koefisien kemiripan 0,47. Kedelai dengan jarak genetik tertinggi dapat digunakan sebagai tetua dalam persilangan.