Penapisan Bakteri Laut yang Berasosiasi dengan Spons sebagai Penghasil Senyawa Bioaktif Anti-Vibrio spp. dan Identifikasinya berdasarkan Gen 16S rRNA.

Abstract

Vibriosis merupakan penyakit pada udang akibat serangan bakteri Vibrio. Penanganan vibriosis selama ini dilakukan dengan pemberian antibiotik. Namun, penggunaan antibiotik yang berlebihan dapat menyebabkan resistensi Vibrio terhadap antibiotik. Eksplorasi senyawa bioaktif sebagai agen biokontrol yang lebih efektif dan ramah lingkungan sangat penting dilakukan. Bakteri yang berasosiasi dengan spons laut dapat menjadi alternatif sumber senyawa bioaktif khususnya anti vibriosis. Penelitian ini bertujuan menapis dan mengidentifikasi secara molekular bakteri laut yang berasosiasi dengan spons yang mampu menghasilkan senyawa bioaktif anti-Vibrio spp. Hasil penapisan terhadap bakteri Vibrio spp. melalui uji antagonis menunjukkan 15 (22%) dari 68 isolat bakteri laut mampu menghambat pertumbuhan setidaknya satu dari tiga jenis Vibrio yaitu V. harveyi, V. parahaemolyticus, dan V. vulnificus. Tiga isolat potensial yaitu D6.6, D6.19, dan P4.17 memiliki spektrum penghambatan terbaik terhadap pertumbuhan bakteri Vibrio diuji aktivitas senyawa bioaktifnya menggunakan supernatan, biakan pekat, dan ekstrak kasar senyawa bioaktif. Berdasarkan sekuens gen 16S rRNA (±1300 pb) isolat tersebut masing-masing adalah Brevibacterium casei galur M Sw oHS, Bacillus altitudinis galur FJAT 47750, dan Bacillus altitudinis galur PgBe190 dengan nilai kemiripan yang tinggi terhadap database Genbank.