Keragaman Morfologi Aktinomiset Endofit Rhododendron spp. dan Penghambatannya Terhadap Bacillus cereus dan Candida albicans

Abstract

Pengembangan potensi senyawa bioaktif baru dari metabolit sekunder yang dihasilkan mikrob termasuk aktinomiset endofit tumbuhan semakin berkembang, diantaranya dimanfaatkan sebagai senyawa antimikrob. Mikrob endofit termasuk aktinomiset diketahui dapat menghasilkan senyawa bioaktif yang sama dengan tanaman inangnya. Sebanyak 17 aktinomiset endofit Rhododendron telah berhasil diisolasi dari batang dan daun, serta dikoleksi di Laboratorium Mikrobiologi IPB. Penelitian ini bertujuan mengkaji keragaman morfologi aktinomiset endofit Rhododendron spp. dan kemampuan penghambatannya terhadap Bacillus cereus dan Candida albicans serta mengidentifikasi aktinomiset endofit terpilih berdasarkan gen 16S rRNA. Metode yang digunakan yaitu peremajaan dan karakterisasi isolat aktinomiset endofit, penapisan aktivitas antimikrob menggunakan Bacillus cereus dan Candida albicans, Aktinomiset endofit terpilih berdasarkan aktivitas antimikrob, diidentifikasi dengan cara mengisolasi dan mengamplifikasi gen 16S rRNA menggunakan primer 27F dan 16Sact1114R, serta menganalisis kekerabatannya dengan membandingkan sekuen gen yang sama dari galur-galur bakteri yang tersimpan di GenBank. Semua isolat aktinomiset endofit Rhododendron spp. menunjukkan keragaman morfologi miselia aerial dan penataan rantai spora dengan tipe yang beragam. Berdasarkan keragaman morfologi isolat aktinomiset endofit Rhododendron spp. memiliki karakter genus Streptomyces. Penapisan uji antimikrob terhadap B. cereus dan C. albicans sebanyak 17 isolat mampu menghambat pertumbuhan B. cereus, dan hanya 3 isolat yang dapat menghambat pertumbuhan C. albicans. Satu isolat menghasilkan daya hambat terhadap B. cereus dan C. albicans tertinggi yaitu isolat RJHB 2. Isolat RJHB 2 memiliki homologi sebesar 85% dengan Streptomyces fradiae NBRC 3439 berdasarkan identifikasi gen 16S rRNA.