Analisis Keragaman Genetika Bakteri Susu Sapi Mastitis Secara Random Amplified Polymorphism DNA-Polymerase Chain Reaction (RAPD-PCR).

Abstract

Penyakit mastitis pada sapi disebabkan oleh berbagai macam bakteri patogenik termasuk yang sudah mengalami resistensi terhadap antibiotik. Identifikasi keragaman bakteri patogen yang mengontaminasi susu sapi perlu dilakukan untuk mendukung pengembangan aplikasi bakteriosin pada sapi mastitis. Penelitian ini bertujuan melakukan identifikasi molekuler pada bakteri susu sapi mastitis melalui analisis RAPD-PCR dan 16S rRNA. Berdasarkan hasil seleksi media terdapat 72 isolat bakteri susu sapi mastitis yang kemudian diekstraksi genomnya dan dilakukan analisis RAPD-PCR. Hasil analisis RAPD-PCR menunjukkan adanya 8 klaster dari dendogram yang kemudian dipilih 4 klaster yang mewakili jenis bakteri dominan pada susu sapi mastitis. Isolat dari 4 klaster diidentifikasi dengan analisis 16S rRNA. Berdasarkan hasil analisis gen 16S rRNA pada bakteri susu sapi mastitis, isolat BPA-12, MHA-6, L-4, dan XLDA-8 teridentifikasi sebagai spesies Staphylococcus aureus, Escherichia coli, Listeria monocytogenes, dan Enterobacter bugandensis.