Validasi Basa Nukleotida Gen 16S rRNA sebagai Dasar Pengelolaan Sumberdaya Mimi (Carcinoscorpius rotundicauda Lattreille, 1802) dari Perairan Pulau Jawa dan Madura.

Abstract

Mimi (Carcinoscorpius rotundicauda) merupakan hewan fosil yang hidup di perairan estuari dan bermangrove yang telah mengalami diversifikasi sejak zaman paleogene (65-23 Mya). Keberadaan spesies ini termasuk dalam kategori data deficient (2015) yang dinyatakan oleh IUCN. Maka dari itu, perlu adanya identifikasi mimi (C. rotundicauda) melalui pendekatan biomolekuler agar diketahui informasi identitas molekuler mimi. Tujuan penelitian ini adalah untuk mengidentifikasi urutan basa nukleotida spesifik gen 16S rRNA dan mengkaji hubungan kekerabatan mimi C. rotundicauda dari Perairan Pulau Jawa dan Madura. Metode yang digunakan yaitu DNA barcoding. Penggunaan marka gen 16S rRNA menghasilkan panjang nukleotida sebesar 451 bp. Konstruksi pohon filogeni memperlihatkan perbedaan yang jelas antara genus Carcinoscorpius dengan genus Tachypleus dimana terdapat 28 situs nukleotida spesifik sebagai penciri spesies.