Karakteristik Gen Cytochrome Oxidase Subunit I (COI) Lobster Panulirus Spp. di Perairan Malang, Jawa Timur

Abstract

Lobster atau udang karang merupakan salah satu anggota kelompok Crustacea yang memiliki nilai ekonomis penting. Lobster merupakan komoditas perikanan yang memberikan konstribusi ekonomi lebih tinggi (88,3%) jika dibandingkan dengan ikan (11,7%). Penelitian ini bertujuan untuk melakukan validasi terhadap lobster Panulirus dan menganalisis hubungan kekerabatan antar spesies berdasarkan teknik DNA barcoding. Sebanyak 7 sampel lobster Panulirus berasal dari Malang yang digunakan adalah spesimen koleksi yang telah diawetkan dalam alkohol. Analisis perbedaan runutan basa nukleotida pada ruas gen COI dibandingkan dengan database pada situs NCBI. Ketiga spesies contoh P. homarus, P. penicillatus, dan P. versicolor dari Malang memiliki nilai persentase kemiripan lebih dari 96% dengan P. homarus, P. penicillatus, dan P. versicolor dari GenBank. Hasil rekonstruksi pohon filogeni menunjukkan bahwa ketiga spesies lobster tersebut memiliki hubungan kekerabatan yang dekat dengan nilai keragaman nukleotida sebesar 0,1860 (18,6%).