Sekuen Parsial Gen Ospin1a Dari Padi Hawara Bunar Dan Mutannya
View/ Open
Date
2017Author
Ayuningtias, Diah Ulil Albab
Miftahudin
Chikmawati, Tatik
Metadata
Show full item recordAbstract
Padi varietas Hawara Bunar merupakan padi toleran aluminium (Al) dan telah
dihasilkan mutan padi Hawara Bunar dengan sifat sensitif Al. Penelitian ini
bertujuan untuk membandingkan sekuen parsial dari gen OsPIN1a pada padi
Hawara Bunar dan mutan Hawara Bunar. Metode penelitian yang dilakukan ialah
perlakuan cekaman Al 15 ppm pada kecambah padi varietas Hawara Bunar dan
mutannya di media kultur hara minimum pH 4. Analisis sifat toleransi terhadap
cekaman Al diukur berdasarkan nilai Root Re-Growth Relative (RGR). Isolasi DNA
dilakukan dengan metode cetyltrimethylammonium bromide (CTAB). Amplifikasi
DNA menggunakan tiga pasang primer yang didesain dari gen OsPIN1a dari padi.
Hasil PCR disekuen menggunakan jasa Macrogen Sequencing Services. Hasil
penelitian menunjukkan panjang sekuen parsial gen OsPIN1a dari Hawara Bunar
dan mutannya yang meliputi intron 2, ekson 3, intron 3, dan sebagian ekson 4
berturut-turut ialah 293 pb dan 291 pb. Sebanyak 18 mutasi nukleotida ditemukan
pada sekuen tersebut, tetapi hanya 6 mutasi terdapat pada ekson 3. Perubahan
nukleotida tersebut mengubah asam amino ke-483 dari valin ke alanin tetapi tidak
mengubah struktur protein yang dibentuk. Asam amino yang berubah mungkin
telah membuat gen OsPIN1a mutan tidak berfungsi normal.
Collections
- UT - Chemistry [2060]