Karakterisasi Ekson dan Intron Gen Defensin 1 pada Apis cerana dan A. dorsata.

Abstract

Gen defensin lebah menyandikan peptida defensin yang berfungsi untuk mempertahankan tubuh dari bakteri Gram positif dan terdapat dua gen defensin, yaitu gen defensin 1 dan 2. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi gen defensin 1 yang terdiri dari ekson 2, intron dan ekson 3 pada A. cerana dan A. dorsata asal Indonesia. DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata diamplifikasi menggunakan primer yang didisain berdasarkan GenBank A. mellifera. Sekuen DNA dan asam amino deduksi dianalisis secara bioinformatika. Panjang sekuen DNA gen defensin 1 sampel A. cerana dan A. dorsata yang didapat berturut-turut sebesar 479 dan 458 pb dan panjang asam amino deduktif kedua sampel berturut-turut sebesar 66 dan 65 dengan 6 asam amino sistein yang diduga menyebabkan terbentuknya ikatan α dan β pada peptide sehingga memungkinkan melisis membran sel bakteri melalui pembentukan pori. Variasi nukleotida di antara spesies A. cerana asal Indonesia dan Korea hanya terdapat pada intron 2 sedangkan antara A. dorsata Indonesia dan Malaysia terdapat pada intron 2 dan ekson 3. Topologi pohon filogeni lebah hasil kontruksi berdasarkan gen defensin 1 mendukung penelitian sebelumnya yaitu A. cerana dan A. dorsata berkerabat lebih dekat dengan A. mellifera dibandingkan dengan A. florea.