Karakterisasi Genom dan Eksplorasi Klaster Gen Biosintetik Aspergillus sp. SM101 Endofit Sirih Merah (Piper crocatum)

Abstract

Kapang endofit dari tanaman sirih merah (Piper crocatum) diketahui sebagai sumber senyawa bioaktif baru yang belum banyak dieksplorasi profil genetiknya. Penelitian ini bertujuan untuk melakukan karakterisasi genom utuh isolat Aspergillus sp. endofit sirih merah guna mengidentifikasi identitas taksonomi, mengkaji gen fungsional terkait adaptasi ekologis, serta mengeksplorasi klaster gen biosintetik pembentuk metabolit sekunder. Metode yang digunakan meliputi sequencing genom utuh, identifikasi molekuler, anotasi genom, dan analisis klaster gen biosintetik secara komputasi. Hasil penelitian menunjukkan bahwa isolat endofit sirih merah berhasil teridentifikasi sebagai Aspergillus aculeatinus dengan ukuran genom 36,58 Mb dan nilai BUSCO 99,1%. Gaya hidup endofit didukung oleh kapasitas metabolik primer dan sekunder serta kemampuan adaptasi yang kuat. Lebih lanjut, genom isolat ini memiliki 88 klaster biosintetik yang memiliki aktivitas biologis antikanker, antibakteri, antijamur, dan insektisida. Implikasi dari penelitian ini menegaskan bahwa pendekatan genomik dan bioinformatika efektif untuk karakterisasi genom kapang secara komprehensif sekaligus mengeksplorasi potensi tersembunyi metabolit sekunder yang bernilai medis dan bioteknologis.