Pengklonan dan Karakterisasi Gen PerL dari Kedelai Peka Cekaman Aluminium

Abstract

Peroksidase diketahui sebagai salah satu gen yang terinduksi oleh cekaman Aluminium (Al). Pada kedelai kultivar Lumut yang diberi cekaman pH 4 + Al 1,6 mM, terlihat adanya ekspresi gen peroksidase (PerL). cDNA PerL telah diisolasi dari akar tanaman kedelai kultivar Lumut. Penelitian ini bertujuan untuk mengkarakterisasi gen peroksidase dari tanaman kedelai kultivar Lumut yang memiliki sifat peka terhadap cekaman Al. Keberadaan cDNA PerL pada cDNA total diamplifikasi dengan menggunakan primer spesifik yang didesain berdasarkan Arabidopsis thaliana (X71794). cDNA PerL disisipkan ke dalam pGEM®-T Easy dan plasmid rekombinan telah berhasil diintroduksi ke dalam Escherichia coli galur DH5á. Pengurutan cDNA PerL dengan DNA sekuencer ABI Prism Model 310 menghasilkan sekitar 1100 pb yang menyandikan 353 asam amino. Analisis kesejajaran lokal nukleotida dengan Per dari beberapa spesies yang terdaftar di GeneBank menunjukkan bahwa cDNA PerL mempunyai persentase kemiripan sebesar 98% dengan DNA Per dari A. thaliana (X71794). Hasil penelusuran daerah domain terkonservasi menunjukkan bahwa asam amino PerL diduga termasuk ke dalam tipe secretory peroxidase.