IPB University Logo

SCIENTIFIC REPOSITORY

IPB University Scientific Repository collects, disseminates, and provides persistent and reliable access to the research and scholarship of faculty, staff, and students at IPB University

AI Repository
 
Building and Categories


      View Item 
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Master Theses
      • MT - Mathematics and Natural Science
      • View Item
      •   IPB Repository
      • Dissertations and Theses
      • Master Theses
      • MT - Mathematics and Natural Science
      • View Item
      JavaScript is disabled for your browser. Some features of this site may not work without it.

      Deteksi Beak and Feather Disease Virus (BFDV) pada Burung Kakatua Indonesia (Genus: Cacatua) dan Asosiasinya dengan Gen MHC

      Thumbnail
      View/Open
      Cover (816.9Kb)
      Fulltext (1.176Mb)
      Lampiran (293.9Kb)
      Date
      2026
      Author
      Ishlah, Azimah Wardahtul
      Widayati, Kanthi Arum
      Dharmayanthi, Anik Budhi
      Metadata
      Show full item record
      Abstract
      Major Histocompatibility Complex (MHC) merupakan kelompok gen pada vertebrata yang mengode molekul penyaji antigen yang berperan penting dalam sistem imun adaptif dengan mempresentasikan peptida patogen kepada sel T. Tingginya polimorfisme gen MHC pada vertebrata diketahui berkontribusi terhadap variasi kemampuan individu dalam merespon infeksi. Pada burung kakatua (genus: Cacatua) di Indonesia, informasi mengenai keragaman gen MHC dan kaitannya dengan kerentanan terhadap penyakit menular masih terbatas, khususnya terhadap infeksi Beak and Feather Disease Virus (BFDV). Virus ini merupakan patogen penting yang menginfeksi burung Psittaciformes yang menyebabkan kerusakan bulu, deformitas paruh, dan imunosupresi. Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi polimorfisme gen MHC-I ekson 3 dan MHC-II ekson 2 pada spesies Cacatua di Indonesia, mendeteksi keberadaan BFDV, serta mengevaluasi asosiasi antara variasi genetik MHC dan status infeksi. Sebanyak 197 sampel darah dari tujuh spesies kakatua penangkaran di Indonesia (Cacatua alba, C. galerita, C. goffiniana, C. moluccensis, C. pastinator, C. sanguinea, dan C. sulphurea) dianalisis untuk deteksi BFDV menggunakan PCR. Selanjutnya, beberapa dari sampel tersebut dilakukan amplifikasi di daerah MHC-I ekson 3 dan MHC-II ekson 2 untuk dianalisis asosiasi antara haplotipe MHC dan status infeksi menggunakan Generalized Linear Model (GLM) binomial. Hasil penelitian menunjukkan bahwa BFDV terdeteksi pada seluruh spesies yang diuji dengan tingkat infeksi berbeda antarspesies. Analisis genetik menunjukkan tingkat polimorfisme yang tinggi pada kedua lokus MHC, namun tidak ditemukan asosiasi signifikan antara variasi haplotipe MHC-I maupun MHC-II dengan status infeksi BFDV. Selain itu, analisis filogenetik menunjukkan pola transmisi lintas spesies tanpa klaster spesifik berdasarkan inang. Temuan ini menunjukkan bahwa meskipun keragaman genetik MHC pada Cacatua relatif tinggi, faktor lain di luar wilayah gen yang dianalisis dapat berperan lebih besar dalam menentukan kerentanan terhadap infeksi BFDV. Penelitian lanjutan dengan jumlah sampel lebih besar serta eksplorasi gen imun lain diperlukan untuk memahami mekanisme kerentanan inang secara lebih komprehensif.
      URI
      http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/173121
      Collections
      • MT - Mathematics and Natural Science [4180]

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository
        

       

      Browse

      All of IPB RepositoryCollectionsBy Issue DateAuthorsTitlesSubjectsThis CollectionBy Issue DateAuthorsTitlesSubjects

      My Account

      Login

      Application

      google store

      Copyright © 2020 Library of IPB University
      All rights reserved
      Contact Us | Send Feedback
      Indonesia DSpace Group 
      IPB University Scientific Repository
      UIN Syarif Hidayatullah Institutional Repository
      Universitas Jember Digital Repository