Show simple item record

dc.contributor.advisorSimanjuntak, Charles Parningotan Haratua
dc.contributor.advisorSulistiono
dc.contributor.advisorSyahailatua, Augy
dc.contributor.authorRomdon, Ahmad
dc.date.accessioned2024-12-16T08:35:45Z
dc.date.available2024-12-16T08:35:45Z
dc.date.issued2024
dc.identifier.urihttp://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/160186
dc.description.abstractIkan gobi amfidromus memanfaatkan muara sungai sebagai jalur migrasi untuk melakukan rekrutmen ke sungai. Kegiatan penangkapan yang dilakukan di muara sungai, seperti nyalawean yang dilakukan setiap bulan oleh masyarakat pesisir di selatan Jawa bagian barat (SJB), akan berdampak pada keberhasilan rekrutmen ikan gobi amfidromus. Nyalawean , yang menargetkan yuwana ikan, dikhawatirkan akan berdampak buruk pada populasi ikan gobi amfidromus, karena kelompok ikan ini sangat rentan mengalami penurunan populasi akibat penangkapan. Oleh karena itu, diperlukan pengelolaan perikanan untuk menjaga populasi ikan gobi amfidromus. Keragaman genetik dan struktur populasi dapat digunakan sebagai parameter dalam pengelolaan perikanan. Akan tetapi, informasi ini masih belum diketahui untuk populasi ikan gobi amfidromus di perairan SJB. Oleh karena itu, penelitian ini dilakukan dalam rangka mengisi kekosongan informasi tersebut. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi ikan gobi amfidromus (Stiphodon semoni) secara morfologi dan molekuler; menguraikan keragaman genetik dan struktur populasinya; dan membandingkan kelimpahannya di antara lima muara sungai. Sampel dikumpulkan pada bulan September-November 2022 dari lima muara sungai yang terletak di perairan SJB. Tiga lokasi, yaitu muara Sungai Cibareno, Sungai Cisolok, dan Sungai Cimaja berada di dalam Teluk Palabuhanratu, sedangkan muara Sungai Cimadur dan Sungai Cikaso berada di luar Teluk Palabuhanratu. Sampel diidentifikasi secara morfologi hingga level famili, sedangkan validasi genus dan spesies dilakukan secara molekuler menggunakan analisis barcoding gen COI dari DNA mitokondria. Indeks keragaman genetik diestimasi menggunakan perangkat lunak DnaSP v6. Struktur genetik diestimasi dengan indeks fiksasi (Fst) dan konektivitas haplotipe. Keseimbangan populasi diestimasi dengan menghitung nilai R2. Arus laut permukaan (~10 m) dianalisis dengan data arus bulanan yang diunduh dari produk GLORYS12V1. Kelimpahan total ikan gobi amfidromus dinyatakan dalam jumlah individu per menit. Selain itu, kelimpahan relatif dari spesies yang teridentifikasi juga dihitung untuk mengidentifikasi dominasinya. Hasil analisis morfologi menunjukkan bahwa myomer berjumlah 22–25; terdapat pigmentasi di bagian mulut, kepala, ventral (sepanjang tubuh), dan pangkal ekor; tubuh cenderung memanjang; ukuran kepala moderat sampai besar; dan ukuran mata kecil sampai moderat. Berdasarkan karakteristik morfologi tersebut sampel teridentifikasi sebagai anggota dari famili Gobiidae. Berdasarkan analisis molekuler, sampel teridentifikasi sebagai Stiphodon semoni dengan persentase kesamaan sebesar 97,58–100%. Berdasarkan analisis morfologi dan molekuler yang dilakukan dalam studi ini, dapat disimpulkan bahwa analisis morfologi tidak cukup untuk mengidentifikasi spesies ikan amfidromus pada tahap yuwana dan untuk itu perlu validasi spesies secara molekuler. Keragaman haplotipe populasi S. semoni di perairan SJB tergolong tinggi, tetapi keragaman nukleotida tergolong rendah. Pola ini mengindikasikan terjadinya penurunan ukuran populasi secara drastis pada spesies tersebut. Berdasarkan nilai Fst dan konektivitas haplotipe tidak terdapat struktur populasi yang berbeda antar kelima populasi. Dengan kata lain, populasi S. semoni di perairan SJB adalah populasi yang saling bercampur, panmictic population. Meskipun, terbentuk dua kelompok berdasarkan kedekatan jarak genetik antar populasi, yaitu populasi Cisolok, Cibareno, dan Cimadur sebagai kelompok pertama, dan populasi Cimaja dan Cikaso sebagai kelompok kedua. Akan tetapi, perbedaan genetik antara kelompok tergolong rendah. Berdasarkan hasil keseimbangan populasi, populasi S. semoni di perairan SJB mengalami ekspansi secara demografi. Hal ini menyebabkan adanya aliran gen yang tinggi antar populasi. Arus permukaan di perairan SJB berperan penting dalam konektivitas antar muara sungai. Pola arus permukaan di perairan SJB adalah searah jarum jam, yaitu massa air mengalir dari barat ke timur, dan terbentuk pusaran di sekitar Teluk Palabuhanratu pada bulan-bulan tertentu. Muara Sungai Cimadur memiliki kelimpahan total tertinggi, ikan amfidromus yang melakukan rekrutmen ke muara Sungai Cimadur sekitar 80 individu per menit. Di sisi lain, muara Sungai Cisolok dan Sungai Cikaso merupakan lokasi penelitian dengan kelimpahan total yang paling sedikit, yaitu sekitar 20 individu per menit. Kelimpahan S. semoni yang paling banyak adalah pada muara Sungai Cimaja, sekitar 90% sampel yang tertangkap adalah S. semoni, sedangkan muara Sungai Cibareno adalah yang terendah, sekitar 15% dari total tangkapan adalah S. semoni. Rekomendasi strategi pengelolaan populasi S. semoni di perairan SJB berdasarkan hasil penelitian adalah dengan membuat kawasan lindung. Strategi ini lebih efektif dibandingkan dengan strategi lainnya. Sungai Cibareno berpotensi menjadi kawasan lindung, karena memiliki keragaman genetik dan jumlah haplotipe khas yang tinggi. Keragaman genetik dan jumlah haplotipe khas yang tinggi akan meningkatkan kemampuan populasi beradaptasi terhadap perubahan lingkungan. Selain itu, Sungai Cibareno memiliki penilaian yang tertinggi terhadap parameter pendukung lainnya. Sungai Cibareno diharapkan dapat menjadi reservat, sumber rekrutmen ikan gobi amfidromus bagi sungai-sungai lain di sekitarnya.
dc.description.sponsorship
dc.language.isoid
dc.publisherIPB Universityid
dc.titleKeragaman Genetik, Struktur Populasi, dan Kelimpahan Yuwana Ikan Gobi Amfidromus (Stiphodon semoni) di Perairan Selatan Jawa Bagian Baratid
dc.title.alternative
dc.typeTesis
dc.subject.keywordkeragaman genetikid
dc.subject.keywordNyalaweanid
dc.subject.keywordPerairan selatan Jawa bagian baratid
dc.subject.keywordStiphodon semoniid
dc.subject.keywordStruktur populasiid


Files in this item

Thumbnail
Thumbnail
Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record