Aktivitas Antibakteri dari Aktinobakteri Endofit Bidara (Ziziphus sp.) terhadap Bakteri Multidrug-resistant dan Identifikasinya

Abstract

Eksplorasi aktivitas antibakteri dari aktinobakteri endofit asal bidara (Ziziphus sp.) perlu dilakukan untuk mendapatkan sumber alternatif baru penghasil antibiotik. Penelitian ini bertujuan mengevaluasi aktivitas antibakteri pada aktinobakteri endofit bidara terhadap lima bakteri multidrug- resistant dan mengidentifikasi isolat potensial melalui pendekatan molekuler berdasarkan gen 16S rRNA. Pada penelitian sebelumnya, 30 isolat aktinobakteri telah berhasil diisolasi dari dari akar, batang, dan daun bidara. Penapisan melalui metode double layer agar diffusion menunjukkan bahwa lima dari 30 isolat aktinobakteri (16%) memiliki aktivitas antibakteri spesifik terhadap methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) dan Bacillus subtilis strain M18. Ekstrak kasar metabolit sekunder dari empat isolat terpilih (BBK 1, DBK 2, DBK 3, dan DBSB 1) juga secara konsisten menujukkan aktivitas penghambatannya terhadap MRSA dengan diamter zona hambat berkisar antara 8±0,8–11±2,9 mm. Minimum inhibitory concentration (MIC) yang ditentukan berdasarkan teknik microbroth-dilution menunjukkan bahwa keempat ekstrak tersebut memiliki MIC yang berkisar 2.500–5.000 μg/mL. Karakterisasi morfologi koloni dan sel pada keempat isolat tersebut menujukkan bahwa isolat-isolat tersebut tergolong aktinobakteri. Berdasarkan identifikasi sekuens gen 16S rRNA, keempat isolat termasuk pada kelompok Streptomyces spp. dengan nilai kemiripan > 99%. Keempat isolat terpilih dapat diteliti dan dikembangkan lebih lanjut sebagai penghasil senyawa anti-MRSA di masa depan.