Analisis keragaman genetik kura-kura air tawar (cuora amboinensis) berdasarkan haplotipe mtDNA

Abstract

Cuora amboinensis merupakan kura-kura air tawar yang termasuk ke dalam ordo Testudines, famili Emydidae dan subfamili Batagurinae. C. amboinensis memiliki penyebaran geografis yang luas, namun tidak ada variasi subspesies yang dapat digambarkan. Selain itu keberadaan C. amboinensis saat ini [erancam punah. Oleh karena itu peflu diadakan penelitian untuk mengetahui keragaman genetik spesies inL Salah satu caranya adalah dengan menggunakan penanda molekular genom mitokondria. Keragarnan genetik mtDNA dapat diketahui melalui penggandaan in vitro sampeJ DNA secara selektif. Bagian yang digandakan bermula dari Cyt b hingga bagian tengah daerah pengendali. Prodllk yang dihasilkan dari proses penggandaan (880 pasang basa) dipotong menggllnakan lima enzim restriksi (MspI, TaqI, MboI, HaeIII dan Hhaf). Pemotongan ini menghasilkan tujuh haplotipe. Dari tujuh haplotipe diperoleh keragaman nukleotida C. amboinensis sebesar 9.6%. Hal ini berarti keragaman nllkleotida C. amboinensis (9.6%) lebih tinggi dari Dogania subplana (6.9%).