| dc.contributor.advisor | Butet, Nurlisa A | |
| dc.contributor.advisor | Riani, Etty | |
| dc.contributor.author | Susanti, Nisa | |
| dc.date.accessioned | 2024-01-23T08:10:02Z | |
| dc.date.available | 2024-01-23T08:10:02Z | |
| dc.date.issued | 2024 | |
| dc.identifier.uri | http://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/135798 | |
| dc.description.abstract | Kerang hijau merupakan hewan filter feeder yang dapat ditemukan di berbagai perairan. Adaptasi terhadap tekanan pencemaran dapat menyebabkan mutasi pada susunan basa nukleotida. Penelitian ini bertujuan membandingkan mutasi basa nukleotida dengan marka gen COI pada kerang hijau (Perna viridis, Linnaeus 1758) yang tertangkap di Teluk Jakarta dan Teluk Penyu. Metode yang digunakan diantaranya isolasi, ekstraksi, amplifikasi, visualisasi, dan sekuensing. Hasil validasi menunjukkan bahwa kerang hijau yang dianalisis adalah Perna viridis dengan persentase 99,55-100,00%. Basa Timin (40,7%) dan basa Adenin (24,4%) mendominasi komposisi basa nukleotida. Keduanya akan membentuk dua ikatan hidrogen yang mudah terlepas dan bermutasi. Komposisi basa nukleotida juga menunjukkan nilai singleton yang kecil yaitu 0.58% yang menunjukkan bahwa mutasi atau perbedaan basa nukleotida antar sampel tidak banyak. Sampel memiliki jarak genetik yang sangat dekat dan menunjukkan adanya kekerabatan. Nilai keragaman nukleotida kerang hijau secara keseluruhan yang didapatkan adalah 0,00431. Nilai ini tergolong kecil sehingga diperlukan pemuliaan untuk menjaga keberlanjutan populasi. | id |
| dc.description.abstract | Green mussels are filter feeder animals that can be found in various waters. Adaptation to pollution pressure can cause mutations in the sequence of nucleotide bases. This study aims to compare nucleotide base mutations with COI gene markers in green mussels (Perna viridis, Linnaeus 1758) caught in Jakarta Bay and Penyu Bay. The methods
used include isolation, extraction, amplification, visualization, and sequencing. The validation results showed that the green mussels analyzed were Perna viridis with a
percentage of 99,55-100.00%. Thymine base (40,7%) and Adenine base (24,4%) dominate the nucleotide base composition. Both of them will form two hydrogen bonds that are easy to come off and mutated. The nucleotide base composition also shows a small singleton value (0,58%), which indicates that there are not many mutations or differences in nucleotide bases between samples. The samples have a very close genetic distance and indicate a kinship relationship. The overall nucleotide diversity value obtained for green mussels was 0,00431. This value is relatively small so breeding is needed to maintain population sustainability. | id |
| dc.language.iso | id | id |
| dc.publisher | IPB University | id |
| dc.title | Mutasi Basa Nukleotida Gen COI pada Kerang Hijau di Lingkungan Perairan Teluk Jakarta dan Teluk Penyu sebagai Dasar Pengelolaan. | id |
| dc.title.alternative | COI Gene Nucleotide Base Mutations in Green Mussels in the Water Environment of Jakarta Bay and Penyu Bay as a Management Basis | id |
| dc.type | Undergraduate Thesis | id |
| dc.subject.keyword | COI | id |
| dc.subject.keyword | Molecular identification | id |
| dc.subject.keyword | Mutation | id |
| dc.subject.keyword | Nucleotide base | id |
