Penambatan Molekuker Kombinasi Tripeptida sebagai Inhibitor Enzim Matriks Metalloproteinase-1

Abstract

Enzim matriks metalloproteinase-1 (MMP-1) berperan dalam mendegradasi kolagen kulit melalui radiasi sinar UV. Molekul tripeptida digunakan sebagai inhibitor MMP-1 sebab lebih unggul dari segi bioavaibilitas dan toksisitas, tetapi belum dianalisis potensi penambatan kombinasinya terhadap aktivitas MMP-1. Penelitian ini bertujuan menentukan potensi inhibisi tripeptida kombinasi pada situs aktif MMP-1 dengan kolagen menggunakan teknik penambatan molekuler kombinasi. Ligan tripeptida dipreparasi dengan menghilangkan molekul air, menambahkan atom hidrogen, dan dikondisikan pada pH 7,4. Ligan tripeptida kombinasi selanjutnya ditambatkan pada sisi aktif MMP-1. Tripeptida tunggal yang terdiri dari tiga residu arginin (RRR) memiliki skor penambatan terbaik dari 121 ligan uji yang lolos seleksi, dengan skor penambatan sebesar -129,27. Ligan kombinasi RRT + RRQ + RRR; RRV + RRR; RRT + RRR memiliki skor penambatan lebih baik daripada RRR, yaitu berturut-turut sebesar -131,298; -130,688; dan -129,483. Ligan RRV + RRR menginhibisi MMP-1 dengan mengikat situs katalitik (His 218, His 222, His 228) serta kofaktor katalitik Zn 265.