Keragaman genetik dan pengembangan metode deteksi cepat penyebab pustul bakteri (Xanthomonas axonopodis pv.glycines) pada kedelai

Abstract

Penyakit pustul bakteri yang disebabkan oleh Xanthomonas axonopodis pv. glycines merupakan salah satu penyakit bakterial penting pada tanaman kedelai yang belum tertangani dengan baik. Oleh karena itu, pemahaman tentang virulensi clan keragaman genetik dari patogen ini serta pengembangan metode deteksi yang cepat dan akurat sangat diperluk.an dalam pengembangan strategi pengendalian penyakit terse but. Penelitian ini bertujuan untuk : (I) menelaah virulensi dan keragaman genetik X axonopodis pv. glycines Xag asal edamame menggunakan teknik PCR-RFLP basil amplifikasi gen 16S-rRNA (ARDRA), teknik ISR 16S-23S-rRNA dan teknik MFLP/PFGE, (2) mengembangkan metode deteksi cepat dan akurat untuk mendeteksi penyakit pustul bakteri pada daun dan benih kedelai secara serologi clan molekular Telah terkoleksi sebanyak 29 isolat X axonopodis pv. glycines dari berbagai pertanaman edamame di )ember, Cipanas, Ciawi dan Bogar. Hasil penelitian menunjuk.kan bahwa isolat-isolat tersebut memiliki tingkat virulensi yang berbeda. Virulensi semua isolat lebih tinggi jika diinokulasi pada tanaman edamame dibanding Wilis atau Orba. Berdasarkan hasil keragaman genetik menggunakan teknik ARDRA, ISR dan MFLP secara berturut-turut diperoleh 6 profil, 7 profit dan 13 profit DNA yang berbeda. Oleh karena itu diperoleh minimal 13 strain X axonopodis pv. glycines yang menginf eksi edamame. lso lat CPI dan JA4 dari Cipanas dan Jember merupakan isolat yang memiliki profil DNA spesifik karena hubungan kekerabatan genetiknya yang cukup jauh dari isolat-isolat lainnya. ..dst