| dc.description.abstract | Reverse transcription loop-mediated isothermal amplification (RT-LAMP)
merupakan metode deteksi baru yang dapat menangani pelacakan kasus Covid-19
secara cepat, sederhana, murah, dan akurat. Tujuan penelitian ini adalah mendesain
primer RT-LAMP menggunakan sekuen genom SARS-CoV-2 yang berasal dari
Indonesia dan beberapa negara lain yang mewakili lima benua di dunia, serta
mewakili lima variant of concern. Metode yang digunakan adalah preparasi sekuen,
uji homologi, identifikasi daerah target, desain primer, identifikasi primer, dan uji
spesifitas primer secara in silico. Hasil penelitian diperoleh set primer T1_9 dengan
urutan basa F3: CACTGAGACTCATTGATGCTATG, B3: CCAACCGTCTCTAAGAAACTCT, F2: GTTCACATCTGATTTGGCTACT, F1c: GAAGTCAACTGAACAACACCACCT, B2: CCTTCCTTAAACTTCTCTTCAAGC, B1c: GTGGCTAACTAACATCTTTGGCACT, LB:
TGAAAAACTCAAACCCGTCCTTG memenuhi parameter ideal dan memiliki
spesifitas terbaik sehingga dapat digunakan untuk uji lanjutan secara in vitro
menggunakan metode RT-LAMP. | id |
