Potensi Tripeptida sebagai Inhibitor Matrix Metalloproteinase-1 untuk Anti Photoaging dan Photocarcinogenesis secara In Silico

Abstract

Matrix Metalloproteinase-1 (MMP-1) adalah enzim yang berperan menginduksi photoaging dan photocarcinogenesis melalui kolagenolisis pada kulit akibat radiasi UV yang sangat rentan terjadi pada masyarakat Indonesia. Peptida sintetis sebagai bahan kosmetik inhibitor MMP-1 lebih menguntungkan dari segi bioavailabilitas dan toksisitas. Penelitian ini bertujuan mendesain tripeptida sintetis inhibitor MMP-1 berdasarkan struktur kolagen serta penapisan melalui penambatan molekuler di YASARA Structure dan prediksi bioavaibilitas dan toksisitas. Desain tripeptida berdasarkan residu situs pengikatan MMP-1 pada kolagen manusia tipe-I dan III, dilanjutkan dengan penapisan tripeptida dengan residu situs pemotongan kolagen, serta keberadaan residu hidrofobik menghasilkan 636 tripeptida potensial inhibitor MMP-1. Prediksi bioavailabilitas dan toksisitas tripeptida untuk aplikasi topikal terhadap 20 ligan dengan energi pengikatan dan konstanta disosiasi terkecil menunjukkan bahwa 10 ligan memenuhi syarat dengan rentang ΔG -8,229 hingga -7,970 kkal/mol. Ligan alami, ligan pembanding, tripeptida RAT, RTP, RAP, RIR, RLQ, RLR, dan RGT menginhibisi MMP-1 melalui pengikatan dengan Zn katalitik serta residu pengikat substrat, sedangkan RGR, PGR, dan RGQ menginhibisi kolagenase-1 melalui pengikatan dengan residu pengikat substrat dan residu katalitik.