Karakterisasi Spesies Stingless Bee asal Bogor, Lebak, dan Luwu Utara Berdasarkan Gen Cytochrome C Oxidase 1

Abstract

Stingless bee merupakan serangga polinator dengan keanekaragaman yang sangat tinggi. Berdasarkan morfologi, terdapat stingless bee yang bersifat cryptic sehingga perlu diidentifikasi secara molekuler dengan menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Penelitian ini bertujuan mengkarakterisasi spesies stingless bee asal Bogor (Jawa Barat), Lebak (Banten), dan Luwu Utara (Sulawesi Selatan) menggunakan DNA barcode berdasarkan gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1). Identifikasi morfologi stingless bee berdasarkan karakteristik tubuh, kepala, propodeum, mesoscutum, mesoscutellum, sayap, dan tungkai. Analisis molekuler stingless bee meliputi ekstraksi DNA, amplifikasi gen COX1, sequencing, analisis haplotipe dan analisis bioinformatik. Berdasarkan identifikasi morfologi stingless bee asal Bogor dan Lebak merupakan Tetragonula laeviceps sedangkan stingless bee asal Luwu Utara merupakan T. aff. biroi. Alignment runutan gen COX1 T. laeviceps hasil penelitian ini membentuk enam haplotipe (H1–H6) dengan variasi sebanyak 20–21 nukleotida antara H1 dengan haplotipe lainnya dan jarak genetik antara H1 dengan haplotipe lainnya adalah 0.036–0.038. Tingginya variasi nukleotida dan jarak genetik pada T. laeviceps membentuk dua kelompok pada pohon filogeni T. laeviceps berdasarkan gen COX1 dengan bootstraps masing-masing sebesar 100% dan 99%. Tingginya variasi pada H1 dan membentuk kelompok terpisah dengan H2–H6 memungkinkan adanya proses cryptic spesies pada T. laeviceps