Show simple item record

dc.contributor.advisorRaffiudin, Rika
dc.contributor.advisorLamerkabel, Jacobus S A
dc.contributor.authorDamayanti, Adelia Ulfie
dc.date.accessioned2020-02-10T08:04:14Z
dc.date.available2020-02-10T08:04:14Z
dc.date.issued2019
dc.identifier.urihttp://repository.ipb.ac.id/handle/123456789/101800
dc.description.abstractApis cerana (Hymenoptera: Apidae) atau dikenal dengan Asian Honeybee memiliki delapan subspesies dengan distribusi di Asia. Penelitian mengenai filogeni dari A. cerana asal beberapa kawasan di Indonesia telah dilakukan melalui gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1) dan Intergenic spacer (IGS) COX1/COX2. Namun penelitian filogeni A. cerana asal Indonesia timur belum dilakukan. Oleh sebab itu, penelitian ini bertujuan menganalisis kekerabatan A. cerana yang terdapat di bagian timur Indonesia melalui gen COX1, gen COX2, dan IGS COX1/COX2. Sampel lebah A. cerana yang digunakan berasal dari Majene (Sulawesi), Ambon, dan Manokwari. Analisis molekular dilakukan dengan ekstraksi, amplifikasi, dan sequencing DNA dilanjutkan dengan analisis bioinformatika dan filogeni. Komposisi rata-rata nukleotida AT pada seluruh sampel DNA adalah 83%. Penelitian ini mendapatkan dua haplotipe baru masing-masing berdasarkan gen COX1 dan gen COX2. Satu haplotipe baru ditemukan berdasarkan IGS COX1/COX2. Lebah A. cerana asal Papua dan Maluku berkerabat dekat dengan A. cerana asal Jawa berdasarkan hasil variasi nukleotida, jarak genetik, dan pohon filogeni gen COX1. Berdasarkan pohon filogeni molekular gen COX1 sangat informatif dalam menunjukkan kekerabatan lebah A. cerana. Gen COX2 dapat menunjukkan kekerabatan antar A. cerana asal Papua dan Maluku dengan Borneo, sedangkan bagian IGS COX1/COX2 tidak dapat menunjukkan kekerabatan antar lokasi A. cerana.id
dc.language.isoidid
dc.publisherIPB Universityid
dc.subject.ddcBiologyid
dc.subject.ddcHoneybeeid
dc.subject.ddc2019id
dc.subject.ddcBogor, Jawa Baratid
dc.titleVariasi DNA Mitokondria Gen Cytochrome C Oxidase 1 (COX1), Gen Cytochrome C Oxidase 2 (COX2), dan Intergenic Spacer COX1/COX2 Apis cerana asal Indonesia Timurid
dc.typeUndergraduate Thesisid
dc.subject.keywordApis ceranaid
dc.subject.keywordDNA mitokondriaid
dc.subject.keywordfilogeniid
dc.subject.keywordhaplotipeid
dc.subject.keywordvariasi genetikid


Files in this item

Thumbnail

This item appears in the following Collection(s)

Show simple item record