| dc.description.abstract | Undur-undur laut hidup di daerah intertidal pantai berpasir.
Pengidentifikasian spesies biota laut sering terjadi kesalahan yang diakibatkan
fenomena cryptic spesies, sehingga perlu dilakukan dengan pendekatan molekuler
berupa teknik DNA barcoding. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi
taksonomi dan hubungan kekerabatan undur-undur laut berdasarkan marka gen 16S
rRNA di perairan Bantul dan Purworejo. Isolasi dan ekstraksi DNA menggunakan
Kit komersil Gene Aid menghasilkan tiga DNA dari setiap lokasi penelitian. DNA
total yang berkualitas baik diamplifikasi menggunakan teknik PCR dengan primer
16S rRNA, sebelum analisis sekuensing. Hasil sekuensing gen 16S rRNA undurundur
laut disejajarkan dengan beberapa sekuen spesies lain yang terdapat di
GeneBank, yaitu genus Emerita, genus Scylla, dan genus Portunus. Sekuensing
dianalisis mengunakan BLASTn. Sekuen dianalisis menggunakan software MEGA
5.0 untuk mendapatkan nilai jarak genetik dan pohon filogenik. Contoh undurundur
laut dari Bantul dan Purworejo tidak berbeda nyata, contoh berasal dari
sumber genetik yang sama. | id |
