Hubungan kekerabatan ikan kembung (Rastrelliger spp.) berdasarkan marka 16S rRNA di WPP 712

Abstract

Ikan kembung lelaki (Rastreliger kanagurta) dan ikan kembung perempuan (Rastrelliger brachysoma) memiliki karakter morfologis yang sangat mirip. Oleh karena itu, kesalahan dalam identifikasi secara morfologi sering terjadi karena adanya fenomena cryptic dan complex species. Penelitian ini bertujuan untuk menentukan hubungan kekerabatan diantara dua spesies ikan kembung berdasarkan marka gen 16S rRNA. Penelitian dilaksanakan pada bulan Mei hingga bulan Desember 2018, dimana contoh dikumpulkan dari tiga lokasi yang mewakili WPP 712 di Lampung Timur, Cirebon, dan Madura. Lima individu diambil dari masing-masing lokasi, dan diawetkan dengan alkohol 96%. Di laboratorium, sebagian kecil jaringan diambil dari bagian bawah sirip dorsal, kemudian diisolasi, ekstraksi, amplifikasi dan sekuensing. Sekuen basa contoh ikan kembung disejajarkan dengan spesies lain yang berasal dari GeneBank menggunakan software MEGA 5.2. Hasil analisis nukleotida menunjukkan bahwa 11 contoh merupakan Rastrelliger kanagurta dan empat contoh lainnya merupakan Rastrelliger brachysoma dengan nilai kedekatan sebesar 99%. Hasil analisis jarak genetik dua spesies berkisar antara 0,000-0,004 dan 0,000-0,006 menunjukkan hubungan kekerabatan yang dekat. Hal ini menunjukkan bahwa pengelolaan untuk kedua spesies ini dapat diperlakukan sebagai satu populasi.