Keragaman Haplotipe Undur-Undur Laut (Albunea symmysta Linnaeus, 1758) berdasarkan Marka Gen 16S rRNA sebagai Dasar Pengelolaan.

Abstract

Albunea symysta merupakan salah satu spesies undur-undur laut yang banyak ditemukan di sepanjang garis pantai selatan Jawa. Pemanfaatan A. symmysta yang tidak didukung dengan adanya pengelolaan dapat mengurangi jumlah populasi A. symmysta. Kajian keragaman haplotipe sebagai langkah awal dalam pengelolaan A. symmysta. Penelitian ini bertujuan mengidentifikasi dan menganalisis keragaman haplotipe A. symmysta yang berasal dari Pantai Parangkusumo, Kabupaten Bantul, Pantai Jetis, Kabupaten Purworejo, dan Pantai Citepus, Kabupaten Sukabumi berdasarkan marka gen 16S rRNA. DNA total hasil isolasi dan ekstraksi diamplifikasi yang kemudian disekuensing untuk mendapatkan urutan basa nukleotida. Basa nukleotida hasil sekuensing dianalisis menggunakan software MEGA 6. Hasil jarak genetik menunjukkan hubungan kekerabatan populasi Bantul dan Purworejo sangat dekat, berbeda dengan kekerabatan antara populasi Sukabumi dengan populasi lainnya. Hasil analisis keragaman menunjukkan bahwa keragaman haplotipe pada lokasi Purworejo dan Sukabumi tergolong tinggi sedangkan keragaman haplotipe lokasi Bantul tergolong rendah.